Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4DQ86TL0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4DQ86TL0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4DQ86TL0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4DQ86TL0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms