Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF554Q86TJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF554Q86TJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF554Q86TJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms