Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM29Q86T20 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM29Q86T20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms