Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIMS2Q7Z4I7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIMS2Q7Z4I7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LIMS2Q7Z4I7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMS2Q7Z4I7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LIMS2Q7Z4I7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms