Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CLASP1Q7Z460 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
CLASP1Q7Z460 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CLASP1Q7Z460 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CLASP1Q7Z460 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CLASP1Q7Z460 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms