Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKD1L3Q7Z443 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PKD1L3Q7Z443 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PKD1L3Q7Z443 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PKD1L3Q7Z443 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PKD1L3Q7Z443 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PKD1L3Q7Z443 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms