Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OTOP3Q7RTS5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP3Q7RTS5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOP3Q7RTS5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP3Q7RTS5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms