Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SSH2Q76I76 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSH2Q76I76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SSH2Q76I76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SSH2Q76I76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SSH2Q76I76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms