Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
H2AFVQ71UI9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H2AFVQ71UI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H2AFVQ71UI9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2AFVQ71UI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms