Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNT7Q6ZNI0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCNT7Q6ZNI0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms