Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM72Q6ZMU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM72Q6ZMU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM72Q6ZMU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM72Q6ZMU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM72Q6ZMU5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM72Q6ZMU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM72Q6ZMU5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms