Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD9BQ6WBX8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD9BQ6WBX8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAD9BQ6WBX8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAD9BQ6WBX8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD9BQ6WBX8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD9BQ6WBX8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms