Protein–RNA interactions for Protein: Q6V1P9

DCHS2, Protocadherin-23, humanhuman

Predictions only

Length 2,916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS2Q6V1P9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCHS2Q6V1P9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCHS2Q6V1P9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS2Q6V1P9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS2Q6V1P9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms