Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SBSNQ6UWP8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SBSNQ6UWP8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SBSNQ6UWP8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SBSNQ6UWP8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SBSNQ6UWP8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SBSNQ6UWP8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SBSNQ6UWP8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SBSNQ6UWP8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SBSNQ6UWP8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SBSNQ6UWP8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms