Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI26

SHQ1, Protein SHQ1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1Q6PI26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHQ1Q6PI26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHQ1Q6PI26 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHQ1Q6PI26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHQ1Q6PI26 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHQ1Q6PI26 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHQ1Q6PI26 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHQ1Q6PI26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms