Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNNM4Q6P4Q7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNNM4Q6P4Q7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNNM4Q6P4Q7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms