Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
EDC4Q6P2E9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
EDC4Q6P2E9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
EDC4Q6P2E9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EDC4Q6P2E9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EDC4Q6P2E9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms