Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFSP1Q6NVU6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UFSP1Q6NVU6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms