Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RETSATQ6NUM9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RETSATQ6NUM9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RETSATQ6NUM9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RETSATQ6NUM9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms