Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHLDB3Q6NSJ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PHLDB3Q6NSJ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHLDB3Q6NSJ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms