Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
VIRMAQ69YN4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
VIRMAQ69YN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VIRMAQ69YN4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VIRMAQ69YN4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
VIRMAQ69YN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms