Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9BQ674R7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9BQ674R7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG9BQ674R7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms