Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD276Q5ZPR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD276Q5ZPR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD276Q5ZPR3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD276Q5ZPR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms