Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TAF3Q5VWG9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF3Q5VWG9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms