Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EEF1A1P5Q5VTE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EEF1A1P5Q5VTE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms