Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RPRD2Q5VT52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RPRD2Q5VT52 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
RPRD2Q5VT52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RPRD2Q5VT52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RPRD2Q5VT52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms