Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF5Q5TYX0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PRAMEF5Q5TYX0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms