Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC122Q5T0U0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC122Q5T0U0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC122Q5T0U0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms