Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms