Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP47Q5SQN1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP47Q5SQN1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP47Q5SQN1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms