Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF628Q5EBL2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF628Q5EBL2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF628Q5EBL2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF628Q5EBL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms