Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT12Q53H54 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRMT12Q53H54 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT12Q53H54 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT12Q53H54 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRMT12Q53H54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRMT12Q53H54 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms