Protein–RNA interactions for Protein: Q496A3

SPATS1, Spermatogenesis-associated serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATS1Q496A3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATS1Q496A3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATS1Q496A3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATS1Q496A3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATS1Q496A3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATS1Q496A3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATS1Q496A3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATS1Q496A3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATS1Q496A3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATS1Q496A3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms