Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SP6Q3SY56 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SP6Q3SY56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SP6Q3SY56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms