Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC57Q2TAC2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC57Q2TAC2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC57Q2TAC2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC57Q2TAC2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC57Q2TAC2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms