Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FOXD1Q16676 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
FOXD1Q16676 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
FOXD1Q16676 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
FOXD1Q16676 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FOXD1Q16676 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
FOXD1Q16676 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
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