Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIF1AQ16665 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIF1AQ16665 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HIF1AQ16665 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIF1AQ16665 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
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