Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX1AQ16623 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX1AQ16623 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX1AQ16623 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STX1AQ16623 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
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