Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTF1Q16619 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTF1Q16619 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTF1Q16619 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTF1Q16619 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTF1Q16619 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2105.4 ms