Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNGA3Q16281 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGA3Q16281 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGA3Q16281 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms