Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM1Q15629 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAM1Q15629 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAM1Q15629 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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