Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF4Q15306 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF4Q15306 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF4Q15306 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF4Q15306 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.2 ms