Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRQ13535 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRQ13535 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRQ13535 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRQ13535 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRQ13535 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRQ13535 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRQ13535 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRQ13535 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRQ13535 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRQ13535 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRQ13535 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRQ13535 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRQ13535 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATRQ13535 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRQ13535 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRQ13535 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRQ13535 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRQ13535 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRQ13535 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRQ13535 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRQ13535 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRQ13535 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRQ13535 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRQ13535 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRQ13535 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRQ13535 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRQ13535 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRQ13535 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRQ13535 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRQ13535 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRQ13535 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRQ13535 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRQ13535 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRQ13535 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRQ13535 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRQ13535 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRQ13535 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRQ13535 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRQ13535 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRQ13535 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRQ13535 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRQ13535 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRQ13535 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRQ13535 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRQ13535 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRQ13535 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRQ13535 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRQ13535 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRQ13535 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRQ13535 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRQ13535 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRQ13535 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRQ13535 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRQ13535 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRQ13535 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRQ13535 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRQ13535 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRQ13535 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRQ13535 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRQ13535 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRQ13535 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRQ13535 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRQ13535 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRQ13535 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRQ13535 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRQ13535 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRQ13535 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRQ13535 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRQ13535 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRQ13535 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRQ13535 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRQ13535 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRQ13535 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRQ13535 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRQ13535 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRQ13535 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRQ13535 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRQ13535 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRQ13535 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRQ13535 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRQ13535 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRQ13535 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRQ13535 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRQ13535 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRQ13535 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRQ13535 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRQ13535 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRQ13535 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRQ13535 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRQ13535 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRQ13535 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRQ13535 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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