Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SCGB2A2Q13296 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCGB2A2Q13296 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SCGB2A2Q13296 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SCGB2A2Q13296 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SCGB2A2Q13296 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCGB2A2Q13296 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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