Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPFIA1Q13136 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA1Q13136 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA1Q13136 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA1Q13136 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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