Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF1Q13077 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAF1Q13077 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
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TRAF1Q13077 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAF1Q13077 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
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