Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTP4A2Q12974 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTP4A2Q12974 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTP4A2Q12974 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTP4A2Q12974 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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