Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

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Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ARHGEF5Q12774 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARHGEF5Q12774 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF5Q12774 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARHGEF5Q12774 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF5Q12774 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
ARHGEF5Q12774 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF5Q12774 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
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