Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 SNP1YIL061C 903 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 AIM2YAL049C 741 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 VTS1YOR359W 1572 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 KIN1YDR122W 3195 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 SEC23YPR181C 2307 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 PAC10YGR078C 600 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 SPE2YOL052C 1191 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 YOR012WYOR012W 414 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 ACO1YLR304C 2337 nt7.27□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 TPI1YDR050C 747 nt7.26□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 MSS51YLR203C 1311 nt7.26□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 HNM1YGL077C 1692 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 LOT6YLR011W 576 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 Q0010Q0010 387 nt7.25□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 EFM1YHL039W 1758 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 POT1YIL160C 1254 nt7.24□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 YCR041WYCR041W 333 nt7.23□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 YKR012CYKR012C 378 nt7.22□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 RRN10YBL025W 438 nt7.22□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 KRE1YNL322C 942 nt7.22□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 ERG12YMR208W 1332 nt7.22□□□□□ -1.25
MSH5Q12175 SNF7YLR025W 723 nt7.21□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 TAF13YML098W 504 nt7.21□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 FCY2YER056C 1602 nt7.2□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 VPS65YLR322W 315 nt7.2□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 CMK2YOL016C 1344 nt7.2□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 HAM1YJR069C 594 nt7.19□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 PRY2YKR013W 990 nt7.19□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 AOS1YPR180W 1044 nt7.19□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 RTC2YBR147W 891 nt7.19□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 YCR061WYCR061W 1896 nt7.19□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 BAP3YDR046C 1815 nt7.18□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 PET10YKR046C 852 nt7.17□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 YLR112WYLR112W 420 nt7.17□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 EMP65YER140W 1671 nt7.16□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 SMK1YPR054W 1167 nt7.16□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 VBA3YCL069W 1377 nt7.16□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 CKI1YLR133W 1749 nt7.15□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 ECM30YLR436C 3825 nt7.15□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 SKY1YMR216C 2229 nt7.15□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 RNA170RNA170 169 nt7.15□□□□□ -1.26
MSH5Q12175 YLR460CYLR460C 1131 nt7.14□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 CLN1YMR199W 1641 nt7.14□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 SDS24YBR214W 1584 nt7.14□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 SMC5YOL034W 3282 nt7.14□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 RSP5YER125W 2430 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 HEL1YKR017C 1656 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 NUP57YGR119C 1626 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 CDC3YLR314C 1563 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 THP3YPR045C 1413 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 NIF3YGL221C 867 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 YJL195CYJL195C 702 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 OLA1YBR025C 1185 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 HXT8YJL214W 1710 nt7.13□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 NAS2YIL007C 663 nt7.12□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 FSH2YMR222C 672 nt7.12□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 YFR020WYFR020W 699 nt7.11□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 YDR327WYDR327W 327 nt7.1□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 GRH1YDR517W 1119 nt7.1□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 CAR2YLR438W 1275 nt7.1□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 CYB2YML054C 1776 nt7.1□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 TOS2YGR221C 1869 nt7.09□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 YGL260WYGL260W 231 nt7.09□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 CHS7YHR142W 951 nt7.09□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 NTG1YAL015C 1200 nt7.09□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 PDC6YGR087C 1692 nt7.09□□□□□ -1.27
MSH5Q12175 YHR033WYHR033W 1272 nt7.08□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 YKL147CYKL147C 618 nt7.08□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 ERV25YML012W 636 nt7.08□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 LIP5YOR196C 1245 nt7.08□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 EXG2YDR261C 1689 nt7.08□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 TUB4YLR212C 1422 nt7.08□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 NUP84YDL116W 2181 nt7.08□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 DST1YGL043W 930 nt7.07□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 GSF2YML048W 1212 nt7.07□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 MET22YOL064C 1074 nt7.07□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 MNN9YPL050C 1188 nt7.07□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 CRN1YLR429W 1956 nt7.06□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 RHO1YPR165W 630 nt7.06□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 ENO1YGR254W 1314 nt7.05□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 ECM27YJR106W 2178 nt7.05□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 MCH2YKL221W 1422 nt7.05□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 HSM3YBR272C 1443 nt7.05□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 PUP3YER094C 618 nt7.05□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 ARC35YNR035C 1029 nt7.05□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 YAH1YPL252C 519 nt7.05□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 THI73YLR004C 1572 nt7.04□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 YEL008WYEL008W 381 nt7.04□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 SHC1YER096W 1539 nt7.04□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 FPR2YDR519W 408 nt7.03□□□□□ -1.28
MSH5Q12175 AFG3YER017C 2286 nt7.02□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 YDR215CYDR215C 414 nt7.02□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 GTT3YEL017W 1014 nt7.02□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 PHB2YGR231C 933 nt7.02□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 RPL2BYIL018W 765 nt7.02□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 ADH3YMR083W 1128 nt7.02□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 ADH7YCR105W 1086 nt7.01□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 MTR3YGR158C 753 nt7.01□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 CTF8YHR191C 402 nt7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.6 ms