Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY1Q0D2K3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY1Q0D2K3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms